MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013851	GACG	2	8	217184	217191	25 %	0 %	50 %	25 %	288939961
4502	NC_013851	CGC	2	6	217204	217209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939961
4503	NC_013851	CGA	2	6	217243	217248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939961
4504	NC_013851	TGC	2	6	217284	217289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939961
4505	NC_013851	GC	3	6	217288	217293	0 %	0 %	50 %	50 %	288939961
4506	NC_013851	CCG	2	6	217294	217299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939961
4507	NC_013851	GAC	2	6	217363	217368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939962
4508	NC_013851	CGGC	2	8	217393	217400	0 %	0 %	50 %	50 %	288939962
4509	NC_013851	CAG	2	6	217487	217492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939962
4510	NC_013851	AAG	2	6	217499	217504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939962
4511	NC_013851	TTC	2	6	217541	217546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939962
4512	NC_013851	GCACCC	2	12	217554	217565	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	288939962
4513	NC_013851	CAC	2	6	217567	217572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939962
4514	NC_013851	GCC	2	6	217583	217588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939962
4515	NC_013851	TCG	2	6	217701	217706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939962
4516	NC_013851	GCC	2	6	217742	217747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939962
4517	NC_013851	GCCGC	2	10	217751	217760	0 %	0 %	40 %	60 %	288939962
4518	NC_013851	GACG	2	8	217784	217791	25 %	0 %	50 %	25 %	288939962
4519	NC_013851	CCG	2	6	217834	217839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939962
4520	NC_013851	TCG	2	6	217875	217880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939962
4521	NC_013851	CG	3	6	217896	217901	0 %	0 %	50 %	50 %	288939962
4522	NC_013851	GC	3	6	217904	217909	0 %	0 %	50 %	50 %	288939962
4523	NC_013851	CTG	2	6	217973	217978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939962
4524	NC_013851	TCA	2	6	218055	218060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939962
4525	NC_013851	TGC	2	6	218061	218066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939962
4526	NC_013851	GC	3	6	218091	218096	0 %	0 %	50 %	50 %	288939962
4527	NC_013851	CGAG	2	8	218103	218110	25 %	0 %	50 %	25 %	288939962
4528	NC_013851	GAG	2	6	218141	218146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939962
4529	NC_013851	GAA	2	6	218339	218344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939962
4530	NC_013851	ACGG	2	8	218383	218390	25 %	0 %	50 %	25 %	288939963
4531	NC_013851	CATC	2	8	218429	218436	25 %	25 %	0 %	50 %	288939963
4532	NC_013851	GCGCC	2	10	218464	218473	0 %	0 %	40 %	60 %	288939963
4533	NC_013851	GC	3	6	218505	218510	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4534	NC_013851	GGT	2	6	218516	218521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939963
4535	NC_013851	TCG	2	6	218533	218538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4536	NC_013851	GC	3	6	218545	218550	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4537	NC_013851	GC	3	6	218600	218605	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4538	NC_013851	GGC	3	9	218606	218614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4539	NC_013851	CAC	2	6	218624	218629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939963
4540	NC_013851	CTG	2	6	218633	218638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4541	NC_013851	CCCG	2	8	218650	218657	0 %	0 %	25 %	75 %	288939963
4542	NC_013851	CGG	2	6	218671	218676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4543	NC_013851	CG	3	6	218719	218724	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4544	NC_013851	TGC	2	6	218725	218730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4545	NC_013851	GGC	2	6	218780	218785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4546	NC_013851	CG	3	6	218856	218861	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4547	NC_013851	CTG	2	6	218898	218903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4548	NC_013851	CGG	2	6	218927	218932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4549	NC_013851	TCG	2	6	218950	218955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4550	NC_013851	GGC	2	6	218987	218992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4551	NC_013851	CCGTGG	2	12	218998	219009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288939963
4552	NC_013851	CG	3	6	219010	219015	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4553	NC_013851	GC	3	6	219042	219047	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4554	NC_013851	CG	4	8	219071	219078	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4555	NC_013851	GC	5	10	219099	219108	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4556	NC_013851	G	6	6	219109	219114	0 %	0 %	100 %	0 %	288939963
4557	NC_013851	CGC	2	6	219202	219207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939963
4558	NC_013851	CGCC	2	8	219214	219221	0 %	0 %	25 %	75 %	288939963
4559	NC_013851	CGG	2	6	219265	219270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939963
4560	NC_013851	ATC	2	6	219280	219285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939963
4561	NC_013851	TCCCT	2	10	219314	219323	0 %	40 %	0 %	60 %	288939963
4562	NC_013851	GCCG	2	8	219434	219441	0 %	0 %	50 %	50 %	288939963
4563	NC_013851	GCC	2	6	219463	219468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939963
4564	NC_013851	GCC	2	6	219480	219485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939963
4565	NC_013851	TCAG	2	8	219544	219551	25 %	25 %	25 %	25 %	288939963
4566	NC_013851	GCT	2	6	219605	219610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939963
4567	NC_013851	G	6	6	219612	219617	0 %	0 %	100 %	0 %	288939963
4568	NC_013851	CCG	2	6	219713	219718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939964
4569	NC_013851	CGG	2	6	219802	219807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939964
4570	NC_013851	TGGT	2	8	219824	219831	0 %	50 %	50 %	0 %	288939964
4571	NC_013851	GGC	2	6	219843	219848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939964
4572	NC_013851	CAG	2	6	219880	219885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939964
4573	NC_013851	TGT	2	6	219978	219983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939964
4574	NC_013851	TGA	2	6	220050	220055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
4575	NC_013851	TGA	2	6	220137	220142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
4576	NC_013851	GAT	2	6	220209	220214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
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4578	NC_013851	CG	4	8	220230	220237	0 %	0 %	50 %	50 %	288939964
4579	NC_013851	AGT	2	6	220278	220283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
4580	NC_013851	CTGAG	2	10	220295	220304	20 %	20 %	40 %	20 %	288939964
4581	NC_013851	CGT	2	6	220305	220310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939964
4582	NC_013851	GCG	2	6	220323	220328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939964
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4584	NC_013851	CAG	2	6	220360	220365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939964
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4587	NC_013851	TGA	2	6	220460	220465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
4588	NC_013851	AGC	2	6	220490	220495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939964
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4590	NC_013851	GAG	2	6	220625	220630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939964
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4592	NC_013851	TGA	2	6	220659	220664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939964
4593	NC_013851	CAC	2	6	220720	220725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939964
4594	NC_013851	CGA	2	6	220794	220799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939964
4595	NC_013851	TCG	2	6	220823	220828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939964
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4598	NC_013851	GCA	3	9	220965	220973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939964
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4601	NC_013851	TCTGA	2	10	221389	221398	20 %	40 %	20 %	20 %	288939965
4602	NC_013851	ACT	2	6	221460	221465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939965
4603	NC_013851	TGC	2	6	221534	221539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939965
4604	NC_013851	GCG	2	6	221551	221556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939965
4605	NC_013851	GTC	3	9	221573	221581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939965
4606	NC_013851	AAGA	2	8	221635	221642	75 %	0 %	25 %	0 %	288939965
4607	NC_013851	CGG	2	6	221676	221681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939965
4608	NC_013851	GAT	2	6	221732	221737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939965
4609	NC_013851	TTCG	2	8	221759	221766	0 %	50 %	25 %	25 %	288939966
4610	NC_013851	TGGT	2	8	221785	221792	0 %	50 %	50 %	0 %	288939966
4611	NC_013851	GCT	2	6	221798	221803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939966
4612	NC_013851	TCGTGC	2	12	221806	221817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939966
4613	NC_013851	TTG	2	6	221910	221915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939966
4614	NC_013851	GTTT	2	8	221956	221963	0 %	75 %	25 %	0 %	288939966
4615	NC_013851	CAT	2	6	222014	222019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939966
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4617	NC_013851	TGC	2	6	222073	222078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939966
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4620	NC_013851	GGT	2	6	222327	222332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939966
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4622	NC_013851	CGT	2	6	222381	222386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939966
4623	NC_013851	CCGCAG	2	12	222435	222446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288939966
4624	NC_013851	TCG	3	9	222466	222474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939966
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4627	NC_013851	CTGAT	2	10	222559	222568	20 %	40 %	20 %	20 %	288939966
4628	NC_013851	GCGT	2	8	222616	222623	0 %	25 %	50 %	25 %	288939966
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4632	NC_013851	TTCGA	2	10	222854	222863	20 %	40 %	20 %	20 %	288939966
4633	NC_013851	CGA	2	6	222899	222904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939966
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4642	NC_013851	CTG	2	6	223245	223250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939966
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